O citrato de clomifeno age de forma indireta sobre o sistema hormonal feminino. Ele interfere nos receptores de estrogênio no cérebro, especificamente no hipotálamo, o que resulta em uma maior produção de hormônios como FSH (hormônio folículo estimulante) e LH (hormônio luteinizante). Esses hormônios são essenciais para a estimulação da ovulação, o que pode ajudar mulheres com distúrbios ovulatórios, como a SOP, a engravidar.